Факультет Теологии является научно-образовательным и административным подразделением Азербайджанского Института Теологии и проводит работу по повышению (и переподготовке) бакалавров, магистров, докторантов по одному или нескольким близким в этой области и направлении специальностям, а также руководит научно-исследовательскими и образовательными работами.